Nach dem Studium und der Promotion in Informatik an der Universität Bonn habilitierte Prof. Baumgarten in Oldenburg in Informatik. Prof. Baumgarten ist seit 1995 Professor für Informatik an der Technischen Universität München (TUM).

Der Schwerpunkt der Forschungsaktivitäten von Prof. Baumgarten liegt auf dem Gebiet der mobilen verteilten Systeme. Die Betriebssysteme – mit Fokus auf eingebetteten, mobilen und webgestützten Betriebssystemen – bilden dabei den wichtigsten Pfeiler. Zudem spielen die drahtlose Kommunikation zwischen Rechensystemen aller Art sowie die Qualität der darauf aufbauenden Dienste wichtige Rollen.

Seit dem Sommersemester 2010 ist Prof. Baumgarten Datenschutzbeauftragter der Technischen Universität München (TUM). Zudem ist er seit mehreren Jahren im Aufsichtsrat der Miray Software AG.

Prof. Baumgarten ist seit Oktober 2016 Research Fellow bei fortiss. Er betreut vorrangig das Kompetenzfeld Automotive System Software and Architecture und unterstützt die Bereiche Architectures and Services for Critical Infrastructures und Model-based Systems Engineering bei einzelnen Themenstellungen.