Prof. Hamacher studierte Physik an den Universitäten Bonn, RWTH Aachen und der Columbia University, New York. Er promovierte 1994 an der Universität Hamburg zum Dr. rer. nat. mit dem Thema „Baryonische B-Zerfälle“. Von 1996 bis 2010 leitete er die Gruppe für Energie- und Systemstudien am Max-Planck-Institut für Plasmaphysik in Garching bei München.

Seit 2010 ist Prof. Hamacher an der Technischen Universität München tätig, wo er seit 2013 den Lehrstuhl für Erneuerbare und Nachhaltige Energiesysteme innehat.

Seine Forschung konzentriert sich auf die Gestaltung von Energiesystemen im Kontext disruptiver Technologien wie Kernfusion, regenerative Energien, Smart Cities und Elektromobilität. Besondere Schwerpunkte seiner Arbeit sind die Integration erneuerbarer Energien in das Stromnetz, innovative nukleare Systeme und städtische Energiesysteme. Prof. Hamacher unterstützt fortiss im Kompetenzfeld Architectures and Services für Critical Infrastructures.